EPI-Dx

Epidemiologische Untersuchung zu Peptid-Signaturen, Immunität, genetischer Prädisposition sowie Veränderungen des SARS-CoV-2

Das Projekt

Suche nach genetischen Faktoren bei COVID-19

Trotz intensiver Forschung zu allen Aspekten der COVID-19-Erkrankung und -Pandemie (COronaVIrus Disease 2019) sind noch immer viele Fragen der Immunisierung und Epidemiologie offen. Insbesondere Fragen zur Entwicklung der Immunität und Infektiosität sind durch den Umstand, dass die Übertragung vor dem Auftreten von Symptomen besonders stark zu sein scheint, schwer zu erforschen. Für die gesundheitspolitische Handlungsfähigkeit sind daher belastbare Erkenntnisse über die Entwicklung der Immunität von größter Bedeutung. Bisher ist auch die Frage, unter welchen Umständen ein leichter oder ein schwerer Verlauf von COVID-19 zu erwarten ist, außerhalb der sogenannten Risikogruppen, noch weitgehend unbekannt. Ebenso unerforscht sind genetische Dispositionen. Können genetische Varianten die unterschiedlichen Verläufe (asymptomatisch-mild, schwer bis tödlich) erklären? Diese und verwandte Fragen sollen im Vorhaben EPI-Dx mit der Sammlung von Daten aus serologischen, genetischen und PCR-Tests nachgegangen werden.

Die Diagnostik kann hier große Beiträge leisten, wenn rechtzeitig und in ausreichender Tiefe differentielle und möglichst vollständige Daten erhoben werden. Vollständig bedeutet in diesem Zusammenhang:

Positive Bestätigung der Infektion (PCR-Test)

Genomprofil des aktuellen Virus

Genetisches Profil des Erkrankten

Unsere Untersuchungen sollen sowohl den individuellen Verlauf der Immunität als auch die Prädisposition der einzelnen Patienten erfassen, dazu werden von Patienten mit milden und schweren Verläufen die genetischen Variationen unter anderem der beteiligten Membranproteine ACE2 und TMPRSS2 genau untersucht.

Berücksichtigt wird neben klinischen Parametern auch die Variation des SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome). Anhand der Ergebnisse soll ein diagnostisches Panel entwickelt werden, welches für die Diagnostik rechtzeitig individualisierte Aussagen zum möglichen Krankheitsverlauf erlaubt.

Das Projekt wird vom Bundesministerium für Bildung und Forschung gefördert (Förderkennzeichen 03COV21).

Partner

Kooperationspartner

Dr. Karsten R. Heidtke

ATLAS Biolabs GmbH - PI

Die ATLAS Biolabs GmbH ist ein europaweit tätiges Forschungs- und Biotechunternehmen mit langjähriger Expertise für Next-Generation-Sequencing- und DNA-Chip-Technologien. Gegründet wurde das Unternehmen 2006 als Spin-off des Deutschen Ressourcenzentrums für Genomforschung und des Cologne Center for Genomics der Universität zu Köln. ATLAS Biolabs kooperiert mit Forschungseinrichtungen, Pharma- und Biotechnologieunternehmen sowie klinischen Forschern und Ärzten im In- und Ausland. 2020 hat das Unternehmen bei Corona-BUND-Studie mitgewirkt, einer bundesweit repräsentativen Untersuchung der SARS-CoV-2-Pandemie.

www.atlas-biolabs.com

Prof. Dr. Jörg-M. Hollidt

in.vent Diagnostica GmbH

Gute Diagnostikprodukte benötigen qualitativ hochwertige humane Biomaterialien (Seren, Standards, Kontrollproben, aufgereinigte Proteine und Antikörper). Aus diesem Bedarf heraus gründeten wir uns 1997 als spin-off der Forschungsabteilung der B.R.A.H.M.S. AG aus. Das Verstehen von Diagnostik und den daraus resultierenden Anforderungen an ein gutes Produkt ist unsere Basis. Wir erkannten den Bedarf für die Herstellung von In-vitro-Diagnostika und spezialisierten uns auf die gesicherte, qualitative und ethisch einwandfreie Beschaffung von biologischem Material. Die in.vent beschafft seit 2000, als unabhängige Instanz, projektorientiert biologische Rohstoffe vor allem für die diagnostische Industrie. Seit 2018 führen wir für unsere Projekte Blutabnahmen in unserem eigenen Studienzentrum „Blut Hilft Forschen“ durch.

www.inventdiagnostica.de

Dr. Arif Malik

MicroDiscovery GmbH

MicroDiscovery ist ein führender Anbieter von innovativen und zertifizierten Softwarelösungen für innovative Diagnostik, individualisierte Medizin und molekularbiologische Forschung. Das Berliner Unternehmen wurde im Jahr 2000 gegründet und hat durch seine hohe Kompetenz in der Realisierung kundenspezifischer Lösungen bereits viele renommierte Unternehmen als Kunden gewonnen. Passende Dienstleistungen, von der biostatistischen Datenanalyse und Algorithmenentwicklung bis zur bioinformatischen Planung und Betreuung komplexer Forschungsprojekte, runden das Angebot der MicroDiscovery GmbH ab.

www.microdiscovery.de